На протяжении многих лет декор бокового нефа составляли многочисленные памятные таблицы, в которых упоминались лица и события, оставившие свой след в истории храма, Люблина и нашей родины. Побригиттский костёл на протяжении многих лет был центром национальных традиций; местом, где отмечались юбилеи народных восстаний, независимости и трагических событий Второй мировой войны. В послевоенный период это было свободное от коммунистического режима место, колыбель Люблинской „Солидарности”. По сей день многие патриотические праздники начинаются со Святой Мессы в этой святыне. История богослужений за Родину насчитывает не одно десятилетие. Начало им положил ректора храма Мечислав Бжозовский. Ему посвящена одна из мемориальных таблиц. Среди других таблиц есть посвящённые маршалу Юзефу Пилсудскому, генералу бригады Казимежу Тумидайскому, генералу бригады Мечиславу Сморавиньскому, солдатам Армии Крайовой, павшим во время Второй мировой войны в огне сражений и в лагерях на востоке: в Катыни, Медном и Харькове. Есть также эпитафии, посвящённые патриотической и социальной деятельности женщин: сестрам Урсулинкам Божене Эмилии Шзервантке, Хелене из Роховских Маслович и Людвике Зембжуской. В 1992 году появилась ещё одна мемориальная доска, посвящённая ректору нашего костёла, в то время еще Слуге Божьему, а сегодня блаженному о. Казимежу Гостыньскому, убитому в газовой камере в Дахау в 1942 году. Среди таблиц, посвящённых ректорам костёла, есть эпитафии о. Яну Владзиньскому, о. Анджею Хляставе, о. Стефану Млинарчику. Эти и другие плиты определили название бокового нефа нашего храма – Люблинский Санктуарий Народной Памяти. После ремонта – в соответствии с рекомендациями реставрационных служб и инструкциями Литургической Комиссии Курии Митрополита в Люблине – таблицы были перегруппированы: часть из них осталась в боковом нефе, а часть была перемещена в колокольню, которая для паломников и туристов доступна для посещения в течение всего дня.
Боковой неф восстановил своё великолепие благодаря новой штукатурке, выполненной в соответствии с готической техникой (песчано-известковая, неровная, волнистая штукатурка), напольному покрытию и освещению. Возле бокового алтаря был открыт также фрагмент старого каменного пола. На западной стене нефа была восстановлена стена из белого камня, а возле бокового входа – фрагменты старинной, оригинальной штукатурки и кирпичной кладки XV века. Под полом нефа находится 5 крипт. Вход в одну из них был застеклён, благодаря чему её можно рассмотреть. Кроме того, изображение из крипты проектируется на колокольню. Реконструкцию бокового алтаря св. Иосифа проект, софинансируемый средствами Евросоюза, не охватывал.
В нефе, в его центральной нише, находится каплица св. Варвары с необарочной статуей Пиеты (рубеж XIX-XX вв.). Очень часто она остаётся незамеченной посетителями. Название часовни напоминает о существовавшей на этом месте часовни Пресвятой Девы Марии, св. Софии и св. Варвары, на месте которой и был построен наш храм. В настоящее время эта часовня исполняет роль катынской часовни: здесь находится мемориальная доска, посвящённая жертвам казни; урна с пеплом погибших в Катыни; пуговицы, найденные в ямах смерти, а также икона Матери Божьей Катынской. В октябре 2012 года тут появилась урна с пеплом убитых в Быковни – подарок воеводы Люблина.
В двух оставшихся более широких нишах, над которыми проходит узкий коридор, соединяющий монастырь с хорами (в настоящее время проход замурован), хранятся ценные исторические исповедальни XVII века. Одна из них была отремонтирована в марте 2009 года. Благодаря расширению стены с южной стороны в XVIII веке у нефа появился дополнительный боковой вход с террасой. Возле этого входа была обустроена платформа для людей с ограниченными возможностями. Этот вход в храм будет функционировать по воскресеньям и в праздничные дни.